藏医把人体的生理功能概括为“隆”（指气、风）、“赤巴”（指火）、“培根”（指粘液）三大因素。 即诞液，在人体内的功能是供营养、长脂肪、调皮肤、正常睡眠等。“培根”也基本分为五种，即：根基培根、研磨培根、尝味培根、餍足培根和粘合培根。
藏医认为，以上三种因素的机能如果在人体内维持了平衡，就出现正常的生理现象。反之，就会产生各种疾病。 藏医还认为，人体是由七种物质组成的，即：饮食的精微及血、肉、脂、骨、髓、精。人体的五脏六腑，不是孤立的存在物，通过经络与其他器官联系在一起，构成了人体有机的整体，人与自然界有密切关系，各项生理功能随着自然界的变化而受到影响。藏医的诊断，采用“望、摸、问”的方法，切脉时，同样以“寸、关、尺”配属五脏六腑，而且十分重视“尿诊”。治疗时，除使用植物、动物、矿物等药物外，还配以穿刺、放血等疗法。胚胎学是藏医学的重要组成部分。早在公元七世纪，藏医就开始了对胚胎学的研究，并初步记述了人体的胚胎发育，《四部医典》中详细记述了胚胎发育的整个过程。《五部遗教》之一的《洛本嘎唐》中也记载：“胚胎首先要经历鱼期，其次要经历龟期和猪期”。藏医对人体发育的研究，在许多方面要早于外国学者。